Entsprechend dem föderativen Aufbau der Bundesrepublik Deutschland haben der Bund und jedes der 16 Länder eine eigene Verfassungsschutzbehörde. Die Zusammenarbeit des Bundesamts für Verfassungsschutz (BfV) mit Sitz in Köln und der Verfassungsschutzbehörden der Länder ist gesetzlich geregelt. Das Bayerische Landesamt für Verfassungsschutz ist eine dem Bayerischen Staatsministerium des Innern unmittelbar nachgeordnete Behörde. Im Haushaltsplan sind ca. 450 Stellen für Beamte, Angestellte und Arbeiter ausgewiesen. Das Haushaltsvolumen beträgt ca. 20 Millionen Euro jährlich. Die Organisation des Amtes stellt sich derzeit wie folgt dar: